Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6V1E1P36543 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms