Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PCGF2P35227 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCGF2P35227 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCGF2P35227 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCGF2P35227 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCGF2P35227 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PCGF2P35227 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms