Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TSPOP30536 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TSPOP30536 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms