Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CMPK1P30085 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CMPK1P30085 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms