Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMB4P28070 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMB4P28070 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms