Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HMGB2P26583 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB2P26583 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms