Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTNNA2P26232 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTNNA2P26232 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms