Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRZ1P23471 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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