Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR3P22607 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FGFR3P22607 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FGFR3P22607 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms