Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERBB3P21860 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERBB3P21860 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms