Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT1P21579 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT1P21579 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT1P21579 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT1P21579 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms