Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM21P19474 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRIM21P19474 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms