Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPN1P18031 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPN1P18031 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms