Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTRB1P17538 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CTRB1P17538 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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