Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB4P17483 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB4P17483 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms