Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ITGA4P13612 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA4P13612 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms