Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCL2P13500 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CCL2P13500 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms