Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
COL6A2P12110 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COL6A2P12110 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms