Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
VPREB1P12018 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms