Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ITGAMP11215 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGAMP11215 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms