Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF888P0CJ79 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF888P0CJ79 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms