Protein–RNA interactions for Protein: P08922

ROS1, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase ROS, humanhuman

Predictions only

Length 2,347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1P08922 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ROS1P08922 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ROS1P08922 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ROS1P08922 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms