Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR3DP05423 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms