Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SFT2D2O95562 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFT2D2O95562 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms