Protein–RNA interactions for Protein: O95104

SCAF4, Splicing factor, arginine/serine-rich 15, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF4O95104 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCAF4O95104 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms