Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM2O94769 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM2O94769 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM2O94769 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECM2O94769 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECM2O94769 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ECM2O94769 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ECM2O94769 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms