Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDKL5O76039 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDKL5O76039 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms