Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
IGSF3O75054 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGSF3O75054 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms