Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GRIN3BO60391 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms