Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP10AO60312 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP10AO60312 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms