Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SCO2O43819 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCO2O43819 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCO2O43819 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCO2O43819 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SCO2O43819 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SCO2O43819 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms