Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFSF14O43557 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFSF14O43557 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms