Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASKO14936 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASKO14936 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASKO14936 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CASKO14936 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms