Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BCKDKO14874 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms