Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TAF4O00268 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TAF4O00268 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TAF4O00268 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TAF4O00268 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TAF4O00268 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF4O00268 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms