Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
J3KR12 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
J3KR12 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
J3KR12 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
J3KR12 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3KR12 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3KR12 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms