Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PMD0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PMD0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PMD0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PMD0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PMD0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms