Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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