Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PTPRNQ16849 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PTPRNQ16849 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
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