Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC015801.1-201ENST00000585651 153 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
HOXD11P31277 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 IYD-202ENST00000344419 8742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 DYRK1A-201ENST00000338785 5498 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 OR4K17-203ENST00000641633 5068 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
HOXD11P31277 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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