Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC5C-201ENST00000453304 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SPOCD1-202ENST00000360482 3960 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNJ1-206ENST00000433931 4852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS4-202ENST00000398145 4497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 DSG1-201ENST00000257192 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 Metazoa_SRP.7-201ENST00000392674 281 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MICG-208ENST00000416822 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AL592114.3-201ENST00000437919 446 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PHKG1P1-201ENST00000442924 614 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN2-207ENST00000448803 3813 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL749P-201ENST00000460421 290 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 IGHV1OR15-3-201ENST00000564926 351 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR6505-201ENST00000617206 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC119619.1-201ENST00000619728 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RGL1-202ENST00000360851 4724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC14A2-203ENST00000586448 3540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 LIPH-201ENST00000296252 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 HSPA4L-201ENST00000296464 10790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105046.1-201ENST00000566457 4997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH5-201ENST00000430863 4164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP3-203ENST00000366496 3996 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NRIP1-202ENST00000400199 7562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NSUN4-209ENST00000537428 2087 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 RCAN2-202ENST00000330430 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MICAL2-202ENST00000342902 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 MYEF2-202ENST00000324324 10360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 LIMK2-202ENST00000333611 3462 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM26-268ENST00000454678 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF252P-201ENST00000426361 5210 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 SCARA3-201ENST00000301904 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KRTAP9-9Q9BYP9 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms