Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
GRIK4Q16099 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GRIK4Q16099 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms