Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA3FQ13275 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SEMA3FQ13275 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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