Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 FAM111B-206ENST00000620384 3405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ATP9BO43861 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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