Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCARF1Q14162 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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