Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CSTF3Q12996 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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