Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
IRF5Q13568 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
IRF5Q13568 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159 ms