Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC103718.1-201ENST00000522667 683 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MBL2-201ENST00000373968 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
HOXD11P31277 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
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