Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LAPTM4AQ15012 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms