Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
TUBA3CQ13748 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TUBA3CQ13748 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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